Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ApofQ91V80 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ApofQ91V80 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms