Protein–RNA interactions for Protein: Q91V10

Vsx1, Visual system homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx1Q91V10 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vsx1Q91V10 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vsx1Q91V10 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsx1Q91V10 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsx1Q91V10 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsx1Q91V10 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsx1Q91V10 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsx1Q91V10 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsx1Q91V10 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsx1Q91V10 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsx1Q91V10 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsx1Q91V10 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsx1Q91V10 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsx1Q91V10 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsx1Q91V10 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsx1Q91V10 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsx1Q91V10 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsx1Q91V10 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vsx1Q91V10 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms