Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEM9

Klhdc3, Kelch domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc3Q8VEM9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhdc3Q8VEM9 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Klhdc3Q8VEM9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhdc3Q8VEM9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhdc3Q8VEM9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhdc3Q8VEM9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhdc3Q8VEM9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhdc3Q8VEM9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhdc3Q8VEM9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhdc3Q8VEM9 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhdc3Q8VEM9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhdc3Q8VEM9 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhdc3Q8VEM9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhdc3Q8VEM9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhdc3Q8VEM9 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Klhdc3Q8VEM9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klhdc3Q8VEM9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klhdc3Q8VEM9 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klhdc3Q8VEM9 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klhdc3Q8VEM9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhdc3Q8VEM9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klhdc3Q8VEM9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms