Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEK2

Rhbdd2, Rhomboid domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd2Q8VEK2 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhbdd2Q8VEK2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhbdd2Q8VEK2 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 187.7 ms