Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU5

Snrk, SNF-related serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrkQ8VDU5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SnrkQ8VDU5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SnrkQ8VDU5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms