Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sft2d2Q8VD57 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d2Q8VD57 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d2Q8VD57 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d2Q8VD57 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d2Q8VD57 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d2Q8VD57 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d2Q8VD57 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d2Q8VD57 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d2Q8VD57 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d2Q8VD57 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d2Q8VD57 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d2Q8VD57 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sft2d2Q8VD57 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d2Q8VD57 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d2Q8VD57 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d2Q8VD57 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d2Q8VD57 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Sft2d2Q8VD57 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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