Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE4

Uncharacterized protein C9orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VCE4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VCE4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VCE4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VCE4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q8VCE4 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q8VCE4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q8VCE4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q8VCE4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VCE4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q8VCE4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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