Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BbxQ8VBW5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BbxQ8VBW5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms