Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBV7

Cops8, COP9 signalosome complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops8Q8VBV7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cops8Q8VBV7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cops8Q8VBV7 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cops8Q8VBV7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cops8Q8VBV7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cops8Q8VBV7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cops8Q8VBV7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cops8Q8VBV7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cops8Q8VBV7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cops8Q8VBV7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cops8Q8VBV7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cops8Q8VBV7 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cops8Q8VBV7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cops8Q8VBV7 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cops8Q8VBV7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cops8Q8VBV7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cops8Q8VBV7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cops8Q8VBV7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cops8Q8VBV7 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cops8Q8VBV7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cops8Q8VBV7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cops8Q8VBV7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cops8Q8VBV7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cops8Q8VBV7 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cops8Q8VBV7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cops8Q8VBV7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cops8Q8VBV7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cops8Q8VBV7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cops8Q8VBV7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cops8Q8VBV7 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cops8Q8VBV7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cops8Q8VBV7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cops8Q8VBV7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cops8Q8VBV7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms