Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2V2

Iffo2, Intermediate filament family orphan 2, mousemouse

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Length 512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iffo2Q8R2V2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Iffo2Q8R2V2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Iffo2Q8R2V2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Iffo2Q8R2V2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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