Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sf3b4Q8QZY9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sf3b4Q8QZY9 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms