Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lin28aQ8K3Y3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lin28aQ8K3Y3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lin28aQ8K3Y3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lin28aQ8K3Y3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lin28aQ8K3Y3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lin28aQ8K3Y3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lin28aQ8K3Y3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lin28aQ8K3Y3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lin28aQ8K3Y3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lin28aQ8K3Y3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lin28aQ8K3Y3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lin28aQ8K3Y3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lin28aQ8K3Y3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lin28aQ8K3Y3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lin28aQ8K3Y3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lin28aQ8K3Y3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lin28aQ8K3Y3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lin28aQ8K3Y3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lin28aQ8K3Y3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lin28aQ8K3Y3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lin28aQ8K3Y3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lin28aQ8K3Y3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lin28aQ8K3Y3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lin28aQ8K3Y3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lin28aQ8K3Y3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lin28aQ8K3Y3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lin28aQ8K3Y3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lin28aQ8K3Y3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lin28aQ8K3Y3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms