Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
OptnQ8K3K8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
OptnQ8K3K8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms