Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cdk5rap2Q8K389 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cdk5rap2Q8K389 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Cdk5rap2Q8K389 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms