Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Phf13Q8K2W6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Phf13Q8K2W6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms