Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Polr1eQ8K202 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Polr1eQ8K202 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms