Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nek9Q8K1R7 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nek9Q8K1R7 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nek9Q8K1R7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms