Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0U3

Tmem17, Transmembrane protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem17Q8K0U3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Tmem17Q8K0U3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem17Q8K0U3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem17Q8K0U3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem17Q8K0U3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem17Q8K0U3 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tmem17Q8K0U3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms