Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0F1

Tbc1d23, TBC1 domain family member 23, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d23Q8K0F1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
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Tbc1d23Q8K0F1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tbc1d23Q8K0F1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Tbc1d23Q8K0F1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Tbc1d23Q8K0F1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Tbc1d23Q8K0F1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tbc1d23Q8K0F1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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Tbc1d23Q8K0F1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms