Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIC2

Nupl2, Nucleoporin-like protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nupl2Q8CIC2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nupl2Q8CIC2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms