Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI71

Vps50, Syndetin, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps50Q8CI71 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps50Q8CI71 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps50Q8CI71 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps50Q8CI71 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps50Q8CI71 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps50Q8CI71 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps50Q8CI71 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps50Q8CI71 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps50Q8CI71 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps50Q8CI71 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps50Q8CI71 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Vps50Q8CI71 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps50Q8CI71 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps50Q8CI71 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps50Q8CI71 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps50Q8CI71 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps50Q8CI71 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps50Q8CI71 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps50Q8CI71 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps50Q8CI71 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps50Q8CI71 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps50Q8CI71 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vps50Q8CI71 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Vps50Q8CI71 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms