Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFK2

Brf1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, mousemouse

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Length 676 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brf1Q8CFK2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Brf1Q8CFK2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brf1Q8CFK2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brf1Q8CFK2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brf1Q8CFK2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brf1Q8CFK2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brf1Q8CFK2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brf1Q8CFK2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Brf1Q8CFK2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brf1Q8CFK2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brf1Q8CFK2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brf1Q8CFK2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Brf1Q8CFK2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brf1Q8CFK2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brf1Q8CFK2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brf1Q8CFK2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brf1Q8CFK2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brf1Q8CFK2 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brf1Q8CFK2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brf1Q8CFK2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brf1Q8CFK2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brf1Q8CFK2 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brf1Q8CFK2 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brf1Q8CFK2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brf1Q8CFK2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brf1Q8CFK2 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brf1Q8CFK2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brf1Q8CFK2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Brf1Q8CFK2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brf1Q8CFK2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brf1Q8CFK2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Brf1Q8CFK2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
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