Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Hpf1Q8CFE2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Hpf1Q8CFE2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Hpf1Q8CFE2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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