Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Usp27Q8CEG8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Usp27Q8CEG8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Usp27Q8CEG8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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Usp27Q8CEG8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
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Usp27Q8CEG8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Usp27Q8CEG8 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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Usp27Q8CEG8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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Usp27Q8CEG8 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Usp27Q8CEG8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Usp27Q8CEG8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp27Q8CEG8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp27Q8CEG8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Usp27Q8CEG8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms