Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vwc2Q8C8N3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vwc2Q8C8N3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms