Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6A8

Bhlhe22, Class E basic helix-loop-helix protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe22Q8C6A8 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Bhlhe22Q8C6A8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Bhlhe22Q8C6A8 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms