Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4J0

Ccdc60, Coiled-coil domain-containing protein 60, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc60Q8C4J0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc60Q8C4J0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc60Q8C4J0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms