Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ3

Lrtm1, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm1Q8BXQ3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lrtm1Q8BXQ3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lrtm1Q8BXQ3 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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