Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXG3

Ift57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift57Q8BXG3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ift57Q8BXG3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ift57Q8BXG3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms