Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXF8

Actrt3, Actin-related protein T3, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt3Q8BXF8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Actrt3Q8BXF8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Actrt3Q8BXF8 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms