Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Ctdsp2Q8BX07 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Ctdsp2Q8BX07 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ctdsp2Q8BX07 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ctdsp2Q8BX07 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ctdsp2Q8BX07 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ctdsp2Q8BX07 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ctdsp2Q8BX07 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ctdsp2Q8BX07 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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