Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Usp38Q8BW70 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Usp38Q8BW70 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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Usp38Q8BW70 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Usp38Q8BW70 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Usp38Q8BW70 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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Usp38Q8BW70 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Usp38Q8BW70 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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Usp38Q8BW70 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
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Usp38Q8BW70 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Usp38Q8BW70 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
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Usp38Q8BW70 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Usp38Q8BW70 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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