Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSZ2

Ap3s2, AP-3 complex subunit sigma-2, mousemouse

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s2Q8BSZ2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap3s2Q8BSZ2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap3s2Q8BSZ2 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap3s2Q8BSZ2 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap3s2Q8BSZ2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap3s2Q8BSZ2 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap3s2Q8BSZ2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ap3s2Q8BSZ2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ap3s2Q8BSZ2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms