Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSA9

Tyw3, tRNA wybutosine-synthesizing protein 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tyw3Q8BSA9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tyw3Q8BSA9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tyw3Q8BSA9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tyw3Q8BSA9 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tyw3Q8BSA9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tyw3Q8BSA9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tyw3Q8BSA9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tyw3Q8BSA9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tyw3Q8BSA9 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tyw3Q8BSA9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tyw3Q8BSA9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tyw3Q8BSA9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tyw3Q8BSA9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tyw3Q8BSA9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tyw3Q8BSA9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tyw3Q8BSA9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tyw3Q8BSA9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms