Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gpc2Q8BKV1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gpc2Q8BKV1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gpc2Q8BKV1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gpc2Q8BKV1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms