Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKU8

Tmem87b, Transmembrane protein 87B, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem87bQ8BKU8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem87bQ8BKU8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem87bQ8BKU8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tmem87bQ8BKU8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem87bQ8BKU8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem87bQ8BKU8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem87bQ8BKU8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem87bQ8BKU8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem87bQ8BKU8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem87bQ8BKU8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem87bQ8BKU8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem87bQ8BKU8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tmem87bQ8BKU8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem87bQ8BKU8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem87bQ8BKU8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem87bQ8BKU8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem87bQ8BKU8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem87bQ8BKU8 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem87bQ8BKU8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem87bQ8BKU8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem87bQ8BKU8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tmem87bQ8BKU8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem87bQ8BKU8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem87bQ8BKU8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem87bQ8BKU8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem87bQ8BKU8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem87bQ8BKU8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tmem87bQ8BKU8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tmem87bQ8BKU8 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tmem87bQ8BKU8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tmem87bQ8BKU8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms