Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIW1

Prune1, Exopolyphosphatase PRUNE1, mousemouse

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Length 454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prune1Q8BIW1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prune1Q8BIW1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prune1Q8BIW1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prune1Q8BIW1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prune1Q8BIW1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prune1Q8BIW1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prune1Q8BIW1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prune1Q8BIW1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prune1Q8BIW1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prune1Q8BIW1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prune1Q8BIW1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prune1Q8BIW1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prune1Q8BIW1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prune1Q8BIW1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prune1Q8BIW1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prune1Q8BIW1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prune1Q8BIW1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prune1Q8BIW1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prune1Q8BIW1 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prune1Q8BIW1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prune1Q8BIW1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prune1Q8BIW1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prune1Q8BIW1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prune1Q8BIW1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prune1Q8BIW1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prune1Q8BIW1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prune1Q8BIW1 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Prune1Q8BIW1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prune1Q8BIW1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prune1Q8BIW1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms