Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ubash3bQ8BGG7 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ubash3bQ8BGG7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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