Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lrrtm2Q8BGA3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms