Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG67

Efr3a, Protein EFR3 homolog A, mousemouse

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Length 819 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3aQ8BG67 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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Efr3aQ8BG67 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Efr3aQ8BG67 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Efr3aQ8BG67 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
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Efr3aQ8BG67 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efr3aQ8BG67 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
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Efr3aQ8BG67 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
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Efr3aQ8BG67 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efr3aQ8BG67 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efr3aQ8BG67 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efr3aQ8BG67 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efr3aQ8BG67 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efr3aQ8BG67 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efr3aQ8BG67 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efr3aQ8BG67 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efr3aQ8BG67 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3aQ8BG67 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3aQ8BG67 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3aQ8BG67 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3aQ8BG67 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3aQ8BG67 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3aQ8BG67 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3aQ8BG67 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3aQ8BG67 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3aQ8BG67 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3aQ8BG67 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3aQ8BG67 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3aQ8BG67 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3aQ8BG67 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3aQ8BG67 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3aQ8BG67 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3aQ8BG67 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3aQ8BG67 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efr3aQ8BG67 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Efr3aQ8BG67 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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