Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tnpo1Q8BFY9 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tnpo1Q8BFY9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms