Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-M10.2Q85ZW9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-M10.2Q85ZW9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.2Q85ZW9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.2Q85ZW9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.2Q85ZW9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.2Q85ZW9 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.2Q85ZW9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-M10.2Q85ZW9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms