Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.4Q85ZW8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.4Q85ZW8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-M10.4Q85ZW8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.4Q85ZW8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms