Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Srgap3Q812A2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Srgap3Q812A2 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srgap3Q812A2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms