Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc50Q810U5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ccdc50Q810U5 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms