Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z96

Vangl1, Vang-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vangl1Q80Z96 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Vangl1Q80Z96 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms