Protein–RNA interactions for Protein: Q80YV3

Trrap, Transformation/transcription domain-associated protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrrapQ80YV3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TrrapQ80YV3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TrrapQ80YV3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms