Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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Zbed4Q80WQ9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Zbed4Q80WQ9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Zbed4Q80WQ9 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Zbed4Q80WQ9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Zbed4Q80WQ9 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Zbed4Q80WQ9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Zbed4Q80WQ9 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Zbed4Q80WQ9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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Zbed4Q80WQ9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
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Zbed4Q80WQ9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
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Zbed4Q80WQ9 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Zbed4Q80WQ9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms