Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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Ell3Q80VR2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ell3Q80VR2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ell3Q80VR2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ell3Q80VR2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ell3Q80VR2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ell3Q80VR2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ell3Q80VR2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ell3Q80VR2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ell3Q80VR2 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ell3Q80VR2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ell3Q80VR2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Ell3Q80VR2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Ell3Q80VR2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Ell3Q80VR2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Ell3Q80VR2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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