Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cfap100Q80VN0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfap100Q80VN0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfap100Q80VN0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfap100Q80VN0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfap100Q80VN0 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfap100Q80VN0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfap100Q80VN0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfap100Q80VN0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfap100Q80VN0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfap100Q80VN0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfap100Q80VN0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfap100Q80VN0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfap100Q80VN0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cfap100Q80VN0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cfap100Q80VN0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cfap100Q80VN0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cfap100Q80VN0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap100Q80VN0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
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